HIS系统采用业界先进的、成熟的软件开发技术支持多种构架模式，主要采用客户/服务器模式（Client/Server）和三层构架模式，开发工具应用主流C#，后台应用数据库为SQL大型数据库支撑。

三层构架通过将整个系统分为不同的逻辑块，大大降低了应用系统开发和维护的成本。三层结构将表示部分和业务逻辑部分按照客户层和应用服务器相分离，客户端和应用服务器、应用服务器和数据库服务器之间的通信以及异构平台之间的数据交换等都可以通过中间件或者相关程序来实现。当数据库或者应用服务器的业务逻辑改变时，客户端并不需要改变，反之亦然，从而大大提高了系统模块的复用性，缩短了开发周期，降低了维护费用。

模块化使得系统很容易在纵向和水平两个方向拓展：一方面可以将系统升级为更大、更有力的平台，同时也可以适当增加规模来增强系统的网络应用。由于摆脱了系统同构性的限制，使得分布数据处理成为可能。在扩充或修改功能时，基本不会破坏原有结构的稳定性。

医院信息系统总体数据管理流程图

系统功能模块

HIS系统

收费

医疗就诊卡管理系统(一卡通)

门诊挂号管理系统

门诊收费管理系统

住院收费管理系统

药剂

门诊药房管理系统

住院药房管理系统

中药房管理系统

西药库管理系统

中药库管理系统

财务

财务管理系统

自定义报表系统

BI大数据分析系统

院长查询管理系统

微信、支付宝应用系统

银医自助应用系统

后勤

中心机房管理系统

材料库房管理系统

固定资产管理系统

接口

医保接口系统

农合接口系统

省版病案管理系统接口

健康四川接口系统

居民健康卡管理系统接口

院感系统接口

合理用药系统接口

处方点评系统接口

手术麻醉系统接口

临床信息系统

医生工作站

门诊医生工作站系统

住院电子医嘱管理系统

住院电子病历管理系统

电子病历质控管理系统

移动系统

移动查房管理系统

移动护理管理系统