区域医院管理系统主要包括：医生工作站、门诊管理系统、住院管理系统、药房管理系统、药库管理系统、财务管理系统、农合管理系统、未执行项目管理等。

医生工作站：此模块医生提交处方为未结算处方，待收款室结算后冲减库存，未结算处方可从未结算管理中删除重开。

门诊管理系统：此模块供没有启用医生工作站模块的医院进行处方使用。收款员提交处方，可直接结算，未结算处方可从未结算管理员中删除重开或修改明细后重新提交。

住院管理系统：此模块为住院病人办理入院登记，完毕后可进行交押金等操作。

药房管理系统：此模块调取的药品信息是药品字典信息，药品按散装单位入库。

药库管理系统：此模块在药库采购录入的时候可以选择调取历史入库信息，同样的药品会弹出详细信息。

财务管理系统：此模块里门诊财务结账是对未结账的财务统计进行结账。

农合管理系统：此模块是参合人员处方结算以后，在此进行报销。

未执行项目管理：单击当日未执行项目可以查询到当日需要执行的项目。也可以通过选定时间段查询，同时也可以通过就诊号、患者姓名进行精确查找。